RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556232.5

AP4S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1, human

TSL 4

Gene AP4S1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP4S1-208	ENST00000556232	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.82	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.82	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	TRIM32	Q13049	653 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	PFAS	O15067	1338 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	GRM8	O00222	908 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	COL6A1	P12109	1028 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	COL9A1	P20849	921 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	NFIA	Q12857	509 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.8	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232		F6X3S4	739 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	PDE8B	O95263	885 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AP4S1-208	ENST00000556232	CYP2B6	P20813	491 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TRIB2	Q92519	343 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ENTPD3	O75355	529 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	VAMP4	O75379	141 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TREML2	Q5T2D2	321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	LHX8	Q68G74	356 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PTPRF	P10586	1907 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	FGFR2	P21802	821 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	RGS3	P49796	1198 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SPP2	Q13103	211 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SLURP2	P0DP57	97 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PRDX5	P30044	214 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SHH	Q15465	462 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TBC1D12	O60347	775 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AP4S1-208	ENST00000556232	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.72	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms