RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-233ENST00000552688 OTOFQ9HC10 1997 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-233ENST00000552688 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-233ENST00000552688 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 CIAO1O76071 339 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PTPRAP18433 802 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 FLT3LGP49771 235 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 NFIAQ12857 509 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 COA7Q96BR5 231 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 A0A1B0GUL6 1792 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TBC1D12O60347 775 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 INHAP05111 366 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PRDX5P30044 214 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ATP2B3Q16720 1220 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PNMA3Q9UL41 463 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GABRQQ9UN88 632 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 BMP8BP34820 402 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 RGS3P49796 1198 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GPR153Q6NV75 609 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 DEFB118Q96PH6 123 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GAKO14976 1311 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 DLL1O00548 723 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ELNP15502 786 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TRIM75PA6NK02 468 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 HMGCRP04035 888 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 LDHCP07864 332 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 CCDC102BQ68D86 513 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 NBPF3Q9H094 633 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 COPRSQ9NQ92 184 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 STAP2Q9UGK3 403 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TNNQ9UQP3 1299 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 RPTORQ8N122 1335 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 BCAR3O75815 825 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 BTDP43251 543 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 PHKA1P46020 1223 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GSTO1P78417 241 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 GDF15Q99988 308 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 SIL1Q9H173 461 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 ABCF2Q9UG63 623 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-233ENST00000552688 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 SPP2Q13103 211 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 PICALMQ13492 652 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 RASGRF1Q13972 1273 aa8.46□□□□□ -1.06
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