RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 PFASO15067 1338 aa8.59□□□□□ -1.03
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CTDSP2-208ENST00000552294 GNRH1P01148 92 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PTPRAP18433 802 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ADORA1P30542 326 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PRMT2P55345 433 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC27Q2M243 656 aa8.59□□□□□ -1.03
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CTDSP2-208ENST00000552294 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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CTDSP2-208ENST00000552294 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM161BQ96MY7 647 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 USP40Q9NVE5 1235 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 PHKA1P46020 1223 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 ARHGEF6Q15052 776 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIB2Q92519 343 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 MRIQ9BWK5 157 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 USP44Q9H0E7 712 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 REV3LO60673 3130 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 PLXNB2O15031 1838 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 IL16Q14005 1332 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 CXCL11O14625 94 aa8.56□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 UBXN2AP68543 259 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 MAP3K10Q02779 954 aa8.56□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.56□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.56□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.56□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.56□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 ALDH1L1O75891 902 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXD10P28358 340 aa8.55□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 PICALMQ13492 652 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 IRF5Q13568 498 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 SIL1Q9H173 461 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.54□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 COL6A1P12109 1028 aa8.54□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 Q3C1V9 767 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.54□□□□□ -1.04
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CTDSP2-208ENST00000552294 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 EYA2O00167 538 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP2B6P20813 491 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 HMGCS2P54868 508 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 SPP2Q13103 211 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-208ENST00000552294 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.53□□□□□ -1.04
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