RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ADD2P35612 726 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PDE1AP54750 535 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 FKBP1BP68106 108 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 CAPNS2Q96L46 248 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 LAMA4Q16363 1823 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 FLT1P17948 1338 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ERC2O15083 957 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ENTPD3O75355 529 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 BAG3O95817 575 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PDE4AP27815 886 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PPP4CP60510 307 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MAP3K11Q16584 847 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 RGMBQ6NW40 437 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ARMC9Q7Z3E5 817 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 CLMNQ96JQ2 1002 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZIC5Q96T25 663 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 STAP2Q9UGK3 403 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 FAM196BA6NMK8 535 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 IGSF3O75054 1194 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SLC10A3P09131 477 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 LCORLQ8N3X6 602 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 CSRNP1Q96S65 589 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ARMT1Q9H993 441 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MBD4O95243 580 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PLCG2P16885 1265 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ECE1P42892 770 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 JMYQ8N9B5 988 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 WRNIP1Q96S55 665 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 FSD1Q9BTV5 496 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 MYH4Q9Y623 1939 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 INPP5BP32019 993 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 GJA5P36382 358 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 USP5P45974 858 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 EVX2Q03828 476 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 VGLL4Q14135 290 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 UBE3CQ15386 1083 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SKAP1Q86WV1 359 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 OSBP2Q969R2 916 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ELP3Q9H9T3 547 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PALD1Q9ULE6 856 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 M0R2C6 588 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 PRKAB2O43741 272 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 NEFLP07196 543 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 DCAF15Q66K64 600 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 APPBP2Q92624 585 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 WNK4Q96J92 1243 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 DNAJC18Q9H819 358 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.4□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 PHF20L1A8MW92 1017 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 MAP3K9P80192 1104 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-211ENST00000548041 NOGQ13253 232 aa10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms