RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544547.5

LIMS1-215, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-215ENST00000544547 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
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LIMS1-215ENST00000544547 MED14O60244 1454 aa16.08■□□□□ 0.16
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LIMS1-215ENST00000544547 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-215ENST00000544547 PPFIA4O75335 1185 aa16.03■□□□□ 0.16
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LIMS1-215ENST00000544547 ATP10DQ9P241 1426 aa16.02■□□□□ 0.16
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