RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 UIMC1Q96RL1 719 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ALAS1P13196 640 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PDE4DQ08499 809 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PTPN14Q15678 1187 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CEP135Q66GS9 1140 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 RTL1A6NKG5 1358 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GNPTABQ3T906 1256 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM87BQ96K49 555 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 JADE2Q9NQC1 790 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TERF1P54274 439 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 MAP9Q49MG5 647 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GBP3Q9H0R5 595 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 INCENPQ9NQS7 918 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 XDHP47989 1333 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 FSD2A1L4K1 749 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ZEB2O60315 1214 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 DEXIO95424 95 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2HP62256 183 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CHRNDQ07001 517 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 BIRC2Q13490 618 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 SPTLC2O15270 562 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 URI1O94763 535 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 RPL13P26373 211 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TTLL7Q6ZT98 887 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TESK2Q96S53 571 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PZPP20742 1482 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TXKP42681 527 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CCNA1P78396 465 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PRPHP41219 470 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TFAP4Q01664 338 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ERFEQ4G0M1 354 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 NEK11Q8NG66 645 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 METP08581 1390 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ADGRL2O95490 1459 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TNNQ9UQP3 1299 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 FLOT1O75955 427 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KRT19P08727 400 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GSDMDP57764 484 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 UBXN4Q92575 508 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 DCTPP1Q9H773 170 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 BCAMP50895 628 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KDRP35968 1356 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KCNQ3O43525 872 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 STX10O60499 249 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KRT9P35527 623 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 AK2P54819 239 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 UBASH3AP57075 661 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PPARAQ07869 468 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 ANO3Q9BYT9 981 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 GAS8O95995 478 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PLCD1P51178 756 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CERKQ8TCT0 537 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 KIFAP3Q92845 792 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 PIM2Q9P1W9 311 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-204ENST00000538708 BRAPQ7Z569 592 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms