RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ERC2O15083 957 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K9P80192 1104 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 CSRNP1Q96S65 589 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 WBP1LQ9NX94 342 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 PDE6AP16499 860 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 SMC5Q8IY18 1101 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 CSADQ9Y600 493 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 IGHDP01880 384 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 MX1P20591 662 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ZIC5Q96T25 663 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 WRNIP1Q96S55 665 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.58■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 ADD2P35612 726 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 SPRYD7Q5W111 196 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 WNK4Q96J92 1243 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 ELP3Q9H9T3 547 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 MYH1P12882 1939 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 USP5P45974 858 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 VGLL4Q14135 290 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 LNPKQ9C0E8 428 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 FLT1P17948 1338 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 CA12O43570 354 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 UBE3CQ15386 1083 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 LAMB1P07942 1786 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 PCNTO95613 3336 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 FOXN1O15353 648 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 SREBF2Q12772 1141 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 OPTNQ96CV9 577 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-222ENST00000532751 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D12O60347 775 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K10Q02779 954 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 NUCB1Q02818 461 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 STAP2Q9UGK3 403 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 INPP5BP32019 993 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 PDE1AP54750 535 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 HLA-DOAP06340 250 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 INHBEP58166 350 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 ERO1BQ86YB8 467 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 TM4SF4P48230 202 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 LCORLQ8N3X6 602 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 OTUD5Q96G74 571 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 DOCK1Q14185 1865 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 SIPA1L1O43166 1804 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 MBD4O95243 580 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 GJA5P36382 358 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 FSD1Q9BTV5 496 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-222ENST00000532751 ARMT1Q9H993 441 aa26.47■■□□□ 1.83
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