RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 EFCC1Q9HA90 598 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 POTEFA5A3E0 1075 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 MCAMP43121 646 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 PI16Q6UXB8 463 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 FAM83AQ86UY5 434 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 TCP10Q12799 353 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 BCL11AQ9H165 835 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.72■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.72■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.72■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 IRF6O14896 467 aa22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 NFIAQ12857 509 aa22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 DCAF15Q66K64 600 aa22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 SPATA5Q8NB90 893 aa22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.71■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 INPP5BP32019 993 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ERO1BQ86YB8 467 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 HOOK2Q96ED9 719 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 MRIQ9BWK5 157 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 SNRKQ9NRH2 765 aa22.7■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 BTBD19C9JJ37 291 aa22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 CETPP11597 493 aa22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 PPIL2Q13356 520 aa22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.69■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ZAP70P43403 619 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 NUCB1Q02818 461 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 SNAPC2Q13487 334 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 FAM151AQ8WW52 585 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 DOCK1Q14185 1865 aa22.68■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ARMC5Q96C12 935 aa22.67■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ATP5JP18859 108 aa22.66■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ZNF384Q8TF68 577 aa22.66■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.66■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 PTPRFP10586 1907 aa22.65■■□□□ 1.22
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PUF60-218ENST00000531995 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.65■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 LNPKQ9C0E8 428 aa22.65■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.65■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 USP40Q9NVE5 1235 aa22.65■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.64■■□□□ 1.22
PUF60-218ENST00000531995 TLR2O60603 784 aa22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 NEFLP07196 543 aa22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ZNF333Q96JL9 665 aa22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.64■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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PUF60-218ENST00000531995 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.63■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.63■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ABCF2Q9UG63 623 aa22.63■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.63■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 RGS3P49796 1198 aa22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 STAP2Q9UGK3 403 aa22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 MGAMO43451 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 GAKO14976 1311 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF6Q15052 776 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 HAUS7Q99871 368 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 CPA4Q9UI42 421 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PDHXO00330 501 aa22.6■■□□□ 1.21
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