RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 BMP8BP34820 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PICK1Q9NRD5 415 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ALPK3Q96L96 1907 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPRFP10586 1907 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 LPIN2Q92539 896 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 GDF15Q99988 308 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 USP40Q9NVE5 1235 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 DOCK2Q92608 1830 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC5A1P13866 664 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PRDX5P30044 214 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ENTPD3O75355 529 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP3K10Q02779 954 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 COA7Q96BR5 231 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 IDI2Q9BXS1 227 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 EYA2O00167 538 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 RGS3P49796 1198 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 DOCK1Q14185 1865 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 DEFB123Q8N688 67 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 USP44Q9H0E7 712 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 SEMA3EO15041 775 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 PNMA3Q9UL41 463 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3-206ENST00000530405 GAKO14976 1311 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM75PA6NK02 468 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 ZBTB22O15209 634 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 HMGCRP04035 888 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF3Q9H094 633 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPRCP08575 1304 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 RPTORQ8N122 1335 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP2B3Q16720 1220 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 FBXO3Q9UK99 471 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 TREML2Q5T2D2 321 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 MRS2Q9HD23 443 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 Q7L0L9 218 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 TDHQ8IZJ6 230 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 TBC1D12O60347 775 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 CIAO1O76071 339 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 SLURP2P0DP57 97 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 SLF2Q8IX21 1173 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 GJD2Q9UKL4 321 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 PHKA1P46020 1223 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 SYN1P17600 705 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-206ENST00000530405 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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