RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA32Q96LK8 384 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 GREM2Q9H772 168 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 VPS18Q9P253 973 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 NTSR2O95665 410 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 BICD2Q8TD16 824 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SUFUQ9UMX1 484 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 BTAF1O14981 1849 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 TM4SF1P30408 202 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 AACSQ86V21 672 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 RAB11FIP3O75154 756 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ME3Q16798 604 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 DONSONQ9NYP3 566 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 PPIP5K2O43314 1243 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 EYA2O00167 538 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ATP8B1O43520 1251 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 NHSQ6T4R5 1651 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 WASHC4Q2M389 1173 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 STYK1Q6J9G0 422 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 IVLP07476 585 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ATP2B4P23634 1241 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 MCM6Q14566 821 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.59□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.58□□□□□ -0.56
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TRPS1-211ENST00000520276 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 KAT2BQ92831 832 aa11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-211ENST00000520276 ITGB4P16144 1822 aa11.58□□□□□ -0.56
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