RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SGSM3Q96HU1 749 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM187AA6NFU0 413 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM177BA6PVY3 158 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOBPA7XYQ1 873 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCSK7Q16549 785 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TM4SF20Q53R12 229 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZD3Q86UT5 571 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NINJ1Q92982 152 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUSD5O60279 629 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACRP10323 421 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SELPP16109 830 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGFR3P22607 806 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STAT3P40763 770 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTSQ03393 145 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IKBKEQ14164 716 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCAPHQ15003 741 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYT9Q86SS6 491 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBR7Q8N806 425 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC35F4A4IF30 521 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNQ2O43526 872 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADCY3O60266 1144 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC25BP30305 580 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 L1CAMP32004 1257 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTBSQ01459 385 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AP3B2Q13367 1082 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MLECQ14165 292 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INPP5AQ14642 412 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PERM1Q5SV97 790 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATG4CQ96DT6 458 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAM19Q9H013 955 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EID1Q9Y6B2 187 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GFRA2O00451 464 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE8AO60658 829 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLCG1P19174 1290 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFKB2Q00653 900 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTM4Q03013 218 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM182BQ5T319 152 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GMIPQ9P107 970 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A087X0B3 334 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.66□□□□□ -1.34
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