RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM42Q8IWZ5 723 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 EPN3Q9H201 632 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 LIN7BQ9HAP6 207 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 SLC12A7Q9Y666 1083 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 MAP3K6O95382 1288 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC26A8Q96RN1 970 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 GRIA4P48058 902 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC14Q15048 493 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.06□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 ALG1L2C9J202 215 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 ATE1O95260 518 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 FCGRTP55899 365 aa3.05□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 AMPD3Q01432 767 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 CEP120Q8N960 986 aa3.05□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.04□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
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