RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 PAGE1O75459 146 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 NEFMP07197 916 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 KCNB2Q92953 911 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 TXKP42681 527 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 NCAPD3P42695 1498 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ERVK-24P63145 666 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 RING1Q06587 406 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 TTLL4Q14679 1199 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 RASIP1Q5U651 963 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 CEP44Q9C0F1 390 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 LGR6Q9HBX8 967 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 NTF4P34130 210 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 COL19A1Q14993 1142 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf49Q9H741 205 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 SMARCA2P51531 1590 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 ABI1Q8IZP0 508 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 RNF214Q8ND24 703 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 PIDD1Q9HB75 910 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 RNF114Q9Y508 228 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM37O94972 964 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 11.2
PDE4D-217ENST00000509355 CDK5R2Q13319 367 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 CBLL1Q75N03 491 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 ISL2Q96A47 359 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 SPG7Q9UQ90 795 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO24O75426 580 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FRMD6Q96NE9 622 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FAM87AP0C7U9 286 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 ATP2B2Q01814 1243 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 LCE3BQ5TA77 95 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 FBXL18Q96ME1 805 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 U3KQE9 123 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 LEFTY1O75610 366 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 CELA3AP09093 270 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 USP17L7P0C7H9 530 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 CBX8Q9HC52 389 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 SAMM50Q9Y512 469 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 GNA15P30679 374 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-217ENST00000509355 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
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PDE4D-217ENST00000509355 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC14Q15048 493 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PPM1JQ5JR12 505 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 SV2BQ7L1I2 683 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 FLCNQ8NFG4 579 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 RNF19AQ9NV58 838 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 FANCGO15287 622 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 OXCT1P55809 520 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 SPRED2Q7Z698 418 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf40Q86WS4 652 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 AK5Q9Y6K8 562 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.49□□□□□ -1.05
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