RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 NR3C2P08235 984 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 HOXC13P31276 330 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SOX5P35711 763 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 GRM5P41594 1212 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 NR1H3Q13133 447 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 KRT72Q14CN4 511 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 E2F5Q15329 346 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ISM2Q6H9L7 571 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SNX32Q86XE0 403 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 VMP1Q96GC9 406 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJC7Q99615 494 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.56□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.56□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 KLF4O43474 513 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 AKAP10O43572 662 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SNX2O60749 519 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM37O94972 964 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CAP2P40123 477 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TRPC1P48995 793 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 NEK2P51955 445 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 STK3Q13188 491 aa8.55□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 DDB1Q16531 1140 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TKFCQ3LXA3 575 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 PARP10Q53GL7 1025 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 LILRB2Q8N423 598 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.55□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TBATAQ96M53 351 aa8.55□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 COQ9O75208 318 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 LMNB1P20700 586 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.54□□□□□ -1.04
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PDCD4-211ENST00000498367 TTC30AQ86WT1 665 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ITPKCQ96DU7 683 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CDH19Q9H159 772 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 RASSF1Q9NS23 344 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.54□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TPPPO94811 219 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 CPEP16870 476 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 NPR3P17342 541 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TYRP1P17643 537 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 GUCY2FP51841 1108 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf87Q6PH81 154 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 PASD1Q8IV76 773 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ARL10Q8N8L6 244 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 AK5Q9Y6K8 562 aa8.53□□□□□ -1.04
PDCD4-211ENST00000498367 ANO9A1A5B4 782 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 SOBPA7XYQ1 873 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 PHKG2P15735 406 aa8.52□□□□□ -1.05
PDCD4-211ENST00000498367 STAT3P40763 770 aa8.52□□□□□ -1.05
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