RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	SEMA3E	O15041	775 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SIMC1-208	ENST00000495423	CIAO1	O76071	339 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SIMC1-208	ENST00000495423	CYP2C8	P10632	490 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SIMC1-208	ENST00000495423	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SIMC1-208	ENST00000495423	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ALPK3	Q96L96	1907 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ENTPD3	O75355	529 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	PRO3102	Q9H379	93 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	GAK	O14976	1311 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	RGS3	P49796	1198 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	MAP3K10	Q02779	954 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	GABRQ	Q9UN88	632 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	PTPRA	P18433	802 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	SIL1	Q9H173	461 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	PICK1	Q9NRD5	415 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	PHKA1	P46020	1223 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	CAPN2	P17655	700 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SIMC1-208	ENST00000495423	ADCY3	O60266	1144 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	SGPL1	O95470	568 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	IRF5	Q13568	498 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	FLT3LG	P49771	235 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	LAMA3	Q16787	3333 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	INHA	P05111	366 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	SLF2	Q8IX21	1173 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	ELN	P15502	786 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	ADORA1	P30542	326 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A1W2PPC1	479 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIM75P	A6NK02	468 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	TBC1D12	O60347	775 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	BTD	P43251	543 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	ABCF2	Q9UG63	623 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	PLXNB2	O15031	1838 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	DEFB118	Q96PH6	123 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	COL6A3	P12111	3177 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	RHBDL3	P58872	404 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	PICALM	Q13492	652 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	COA7	Q96BR5	231 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	EVI5	O60447	810 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	TIMM10	P62072	90 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	TREML2	Q5T2D2	321 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17

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