RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASPAP45381 313 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCL1Q15111 1095 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF19AQ9NV58 838 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.25□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GIPC1O14908 333 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AOC2O75106 756 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FUT4P22083 530 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LGR6Q9HBX8 967 aa8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD8BP10966 210 aa8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.23□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD96P40200 585 aa8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBLN7Q53RD9 439 aa8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FRMD6Q96NE9 622 aa8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C12orf49Q9H741 205 aa8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPG7Q9UQ90 795 aa8.22□□□□□ -1.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DBX1A6NMT0 343 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMPRSS2O15393 492 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERCC3P19447 782 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNA15P30679 374 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSTT1P30711 240 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAD18Q9NS91 495 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.21□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK5R2Q13319 367 aa8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MISP3Q96FF7 219 aa8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CORO1BQ9BR76 489 aa8.2□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NETO1Q8TDF5 533 aa8.19□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.19□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.19□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.19□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.19□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.19□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BIN1O00499 593 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM87AP0C7U9 286 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGD1P98174 961 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP3B2Q13367 1082 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM168AQ92567 244 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARP2Q9UGN5 583 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AK5Q9Y6K8 562 aa8.18□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF862O60290 1169 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L7P0C7H9 530 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MESP2Q0VG99 397 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK35Q8TDR2 534 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.17□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LEFTY1O75610 366 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIG1P18858 919 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAB2P98082 770 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKCQQ04759 706 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDZD3Q86UT5 571 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DISC1Q9NRI5 854 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAV3Q9UKW4 847 aa8.16□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENC1O14682 589 aa8.15□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OXCT1P55809 520 aa8.15□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE3AQ14432 1141 aa8.15□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.15□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.15□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO24O75426 580 aa8.14□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP44Q9C0F1 390 aa8.14□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAGE1O75459 146 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP6P22004 513 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NME2P22392 152 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms