RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495174.5

SH3BP1-208, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 947 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-208ENST00000495174 WNK4Q96J92 1243 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 MYH1P12882 1939 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 GCC1Q96CN9 775 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 WRNIP1Q96S55 665 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 CYP7A1P22680 504 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 PICALMQ13492 652 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 VGLL4Q14135 290 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 TEX11Q8IYF3 940 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 HAUS7Q99871 368 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 GOLIM4O00461 696 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 TBC1D12O60347 775 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 LBX1P52954 281 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 OPTNQ96CV9 577 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 BCL11AQ9H165 835 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ELP3Q9H9T3 547 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 DOCK1Q14185 1865 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ALDH1A1P00352 501 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ERO1BQ86YB8 467 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 RNF186Q9NXI6 227 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 SIPA1L1O43166 1804 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1-208ENST00000495174 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 TRPA1O75762 1119 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PDE6AP16499 860 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 GJA5P36382 358 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 GTF2A2P52657 109 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PPATQ06203 517 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 FLT1P17948 1338 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 NAV1Q8NEY1 1877 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PHF20L1A8MW92 1017 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ERC2O15083 957 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 INPP5BP32019 993 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PPIL2Q13356 520 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 IFNL1Q8IU54 200 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ADD2P35612 726 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 OTUD5Q96G74 571 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 PTPRFP10586 1907 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 USP5P45974 858 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 UBE3CQ15386 1083 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-208ENST00000495174 SMC5Q8IY18 1101 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms