RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SYP-208ENST00000494396 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SYP-208ENST00000494396 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SYP-208ENST00000494396 C4AP0C0L4 1744 aa19.14■□□□□ 0.66
SYP-208ENST00000494396 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 STK3Q13188 491 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SYT10Q6XYQ8 523 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 RGS22Q8NE09 1264 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 UBXN6Q9BZV1 441 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 DNAI1Q9UI46 699 aa19.14■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ERICH4A6NGS2 130 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 JAK2O60674 1132 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 FGFR2P21802 821 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 MYH7P12883 1935 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 IKBKBO14920 756 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SLC5A1P13866 664 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 PLA2G4AP47712 749 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 FSIP1Q8NA03 581 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 MNS1Q8NEH6 495 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 NLRP3Q96P20 1036 aa19.13■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 RXRBP28702 533 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SCARF1Q14162 830 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 Q6ZUG5 572 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 DSCC1Q9BVC3 393 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 KIAA1468Q9P260 1216 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 CBFA2T2O43439 604 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 MAST3O60307 1309 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SDF4Q9BRK5 362 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 NPHP1O15259 732 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ZSCAN12O43309 604 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 CYP21A2P08686 494 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ME1P48163 572 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 TXNRD1Q16881 649 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 HOMER1Q86YM7 354 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 TCEANC2Q96MN5 208 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 AGXT2Q9BYV1 514 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 PSD3Q9NYI0 1048 aa19.11■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ZAP70P43403 619 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SCRN1Q12765 414 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 CCDC102BQ68D86 513 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 LAMA4Q16363 1823 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 TADA3O75528 432 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 MCAMP43121 646 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 CHRNDQ07001 517 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 PDE4CQ08493 712 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 NFIXQ14938 502 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 TMC6Q7Z403 805 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 USP28Q96RU2 1077 aa19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SALL1Q9NSC2 1324 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 DTNBO60941 627 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 YEATS4O95619 227 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 PHKA1P46020 1223 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 M0R2C6 588 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 SMC2O95347 1197 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 NLRP12P59046 1061 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 PROM2Q8N271 834 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 IFNKQ9P0W0 207 aa19.09■□□□□ 0.65
SYP-208ENST00000494396 PLSCR1O15162 318 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 CAPN2P17655 700 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 TUBB4BP68371 445 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 PI16Q6UXB8 463 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 FBXL16Q8N461 479 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 OSBP2Q969R2 916 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 TMX1Q9H3N1 280 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 ST7Q9NRC1 585 aa19.08■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 CNBD1Q8NA66 436 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 DDX11Q96FC9 970 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 GYS1P13807 737 aa19.07■□□□□ 0.64
SYP-208ENST00000494396 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms