RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D12O60347 775 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 CTSWP56202 376 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 CST9Q5W186 159 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 FERMT3Q86UX7 667 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.3□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 GORABQ5T7V8 394 aa8.3□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 ST3GAL1Q11201 340 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 FAM177BA6PVY3 158 aa8.29□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 UBE4AQ14139 1066 aa8.29□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.29□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 NIM1KQ8IY84 436 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 HAUS7Q99871 368 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 PPFIA3O75145 1194 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 ZNF445P59923 1031 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 NOGQ13253 232 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.29□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 MBD3O95983 291 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 F13A1P00488 732 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 RPS6KB1P23443 525 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 KCNQ4P56696 695 aa8.28□□□□□ -1.08
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HERC4-211ENST00000492996 HOOK2Q96ED9 719 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 FOSBP53539 338 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 PI16Q6UXB8 463 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC4-211ENST00000492996 CYP21A2P08686 494 aa8.27□□□□□ -1.09
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HERC4-211ENST00000492996 MPNDQ8N594 471 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 MTMR6Q9Y217 621 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 MAST3O60307 1309 aa8.27□□□□□ -1.09
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HERC4-211ENST00000492996 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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HERC4-211ENST00000492996 PRO3102Q9H379 93 aa8.27□□□□□ -1.09
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HERC4-211ENST00000492996 JAK2O60674 1132 aa8.26□□□□□ -1.09
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HERC4-211ENST00000492996 GPSM2P81274 684 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 SCARF1Q14162 830 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.26□□□□□ -1.09
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HERC4-211ENST00000492996 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZUG5 572 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 BRF1Q92994 677 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 XAGE2Q96GT9 111 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 MAP7D2Q96T17 732 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HERC4-211ENST00000492996 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.26□□□□□ -1.09
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