RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 IRF6O14896 467 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 PPIL2Q13356 520 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ZAP70P43403 619 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 SLURP2P0DP57 97 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 AK9Q5TCS8 1911 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 CETPP11597 493 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 PPATQ06203 517 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 SNAPC2Q13487 334 aa22.07■■□□□ 1.12
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PTPRU-207ENST00000492954 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 AACSQ86V21 672 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 BTBD19C9JJ37 291 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 APBB1O00213 710 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 HMMRO75330 724 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K10Q02779 954 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 TEX11Q8IYF3 940 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 DOCK2Q92608 1830 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 PDE3AQ14432 1141 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTPRU-207ENST00000492954 SP3Q02447 781 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 ERO1AQ96HE7 468 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 PICK1Q9NRD5 415 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 HTTP42858 3142 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-207ENST00000492954 FAM196BA6NMK8 535 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRU-207ENST00000492954 CAP1Q01518 475 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 PLCG2P16885 1265 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 PTPRAP18433 802 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 CYP7A1P22680 504 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 RGS19P49795 217 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 PPP4CP60510 307 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 BCL11AQ9H165 835 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D12O60347 775 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 IGSF3O75054 1194 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 SOX10P56693 466 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 MOGSQ13724 837 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 RAB11FIP3O75154 756 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRU-207ENST00000492954 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 PDHXO00330 501 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 CXCL11O14625 94 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 TLR2O60603 784 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 EFCC1Q9HA90 598 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 FLT1P17948 1338 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K12Q12852 859 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-207ENST00000492954 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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