RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	SERPINB4	P48594	390 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	STK35	Q8TDR2	534 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952		H3BRB1	525 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	NTF4	P34130	210 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	AOC3	Q16853	763 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	UST	Q9Y2C2	406 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTC3-222	ENST00000491952	NDUFB5	O43674	189 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ERVK-24	P63145	666 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ISL2	Q96A47	359 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	PIDD1	Q9HB75	910 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	RING1	Q06587	406 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	CSRNP1	Q96S65	589 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ARNT	P27540	789 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	SULF2	Q8IWU5	870 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TTC3-222	ENST00000491952	EOMES	O95936	686 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	NME2	P22392	152 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	FCGRT	P55899	365 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PI16	Q6UXB8	463 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ASB11	Q8WXH4	323 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	KCNB2	Q92953	911 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	KRT1	P04264	644 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	BMP6	P22004	513 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	DSC3	Q14574	896 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	KSR1	Q8IVT5	923 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	BCO2	Q9BYV7	579 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	FYB2	Q5VWT5	728 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	TSPAN15	O95858	294 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	CLCN7	P51798	805 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	SLC38A3	Q99624	504 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ITIH2	P19823	946 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	CFP	P27918	469 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	ZP2	Q05996	745 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTC3-222	ENST00000491952	PKN1	Q16512	942 aa		6.17	□□□□□ -1.42

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