RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 LEFTY1O75610 366 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 CEACAM5P06731 702 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 KCNB2Q92953 911 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ITGA4-211ENST00000490435 GPR182O15218 404 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 CD96P40200 585 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 OXCT1P55809 520 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF124Q15973 351 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 PKN1Q16512 942 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 CSRNP1Q96S65 589 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 U3KQE9 123 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 DBX1A6NMT0 343 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 IGHA2P01877 340 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 FCGRTP55899 365 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 PDZD3Q86UT5 571 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 KSR1Q8IVT5 923 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ISL2Q96A47 359 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 NEFMP07197 916 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 SULF2Q8IWU5 870 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ERVK-24P63145 666 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 RNF214Q8ND24 703 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 SLC38A3Q99624 504 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ITIH2P19823 946 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 ARNTP27540 789 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA4-211ENST00000490435 NME2P22392 152 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 STK35Q8TDR2 534 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 ASB11Q8WXH4 323 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 BCO2Q9BYV7 579 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 IKZF1Q13422 519 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 PI16Q6UXB8 463 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 FAM84AQ96KN4 292 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 FBLN7Q53RD9 439 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 CBX8Q9HC52 389 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 ZP2Q05996 745 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 KCNMB1Q16558 191 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 PICK1Q9NRD5 415 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 MESP2Q0VG99 397 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 PPM1JQ5JR12 505 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 SAMM50Q9Y512 469 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA4-211ENST00000490435 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.58□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.58□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 TMC7Q7Z402 723 aa8.58□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 CLCN7P51798 805 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 MLANAQ16655 118 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 CSADQ9Y600 493 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 FANCGO15287 622 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 NTF4P34130 210 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 AFMP43652 599 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 LCE4AQ5TA78 99 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA4-211ENST00000490435 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.56□□□□□ -1.04
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