RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	LINC01559	Q495D7	138 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ERAP2	Q6P179	960 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163		A6NHS1	94 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PAGE1	O75459	146 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SRGN	P10124	158 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF516	Q92618	1163 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	UBP1	Q9NZI7	540 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TIMP2	P16035	220 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GUCY2C	P25092	1073 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GRIA4	P48058	902 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATC1	Q76KD6	591 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT82	Q9NSB4	513 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	CELA3A	P09093	270 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SOX5	P35711	763 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF217	Q8TC41	542 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	C1orf159	Q96HA4	380 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	USP20	Q9Y2K6	914 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	HMGXB3	Q12766	1538 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GABRD	O14764	452 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	AKAP10	O43572	662 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	BPNT1	O95861	308 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	EDN3	P14138	238 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	FSHR	P23945	695 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	POLD1	P28340	1107 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PRR20E	P86478	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PRR20C	P86479	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PRR20D	P86480	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PRR20B	P86481	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PRR20A	P86496	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	RASSF7	Q02833	373 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ASMTL	O95671	621 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	CYP4F3	Q08477	520 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	FERMT3	Q86UX7	667 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXO27	Q8NI29	283 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ZEB2	O60315	1214 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	MSX1	P28360	303 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	FAP	Q12884	760 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GMCL1	Q96IK5	515 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SWAP70	Q9UH65	585 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	F2	P00734	622 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SDS	P20132	328 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GPR158	Q5T848	1215 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UBXN4-208	ENST00000490163	TMC1	Q8TDI8	760 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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