RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 IDI2Q9BXS1 227 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 CCL5P13501 91 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 PTPRAP18433 802 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 PRKCZQ05513 592 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 MEIS3Q99687 375 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 PICK1Q9NRD5 415 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 GABRQQ9UN88 632 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 GAKO14976 1311 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 FCGRTP55899 365 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 PICALMQ13492 652 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 RASGRF1Q13972 1273 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 RNF208Q9H0X6 261 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 COPRSQ9NQ92 184 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 BTDP43251 543 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 TFCP2Q12800 502 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GUL7 405 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 GJA8P48165 433 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 UBXN2AP68543 259 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K10Q02779 954 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 XAGE2Q96GT9 111 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM75PA6NK02 468 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 GJB1P08034 283 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SLF2Q8IX21 1173 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 PTPRFP10586 1907 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 DOCK1Q14185 1865 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 MECOMQ03112 1051 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 FAM196BA6NMK8 535 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SRGAP3O43295 1099 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 ADCY3O60266 1144 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 ELNP15502 786 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 FLT3LGP49771 235 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF384Q8TF68 577 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 CEP290O15078 2479 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB22O15209 634 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 RHBDL3P58872 404 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SZT2Q5T011 3432 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 TREML2Q5T2D2 321 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 PI16Q6UXB8 463 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
PTPRN-217ENST00000489650 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 SGPL1O95470 568 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 INHAP05111 366 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 TBC1D12O60347 775 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 GNAI3P08754 354 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 GORABQ5T7V8 394 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA5Q8NB90 893 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 RAI14Q9P0K7 980 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 TNNQ9UQP3 1299 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 SPP2Q13103 211 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB118Q96PH6 123 aa22.8■■□□□ 1.24
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