RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 NBPF3Q9H094 633 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ZMYM6O95789 1325 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF213O14771 459 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 LMAN1P49257 510 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 GRIN1Q05586 938 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SLC20A2Q08357 652 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TTC39AQ5SRH9 613 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MICU3Q86XE3 530 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MYL10Q9BUA6 226 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CPDO75976 1380 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 STX10O60499 249 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ZAP70P43403 619 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 NBPF26B4DH59 902 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 GPAA1O43292 621 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TXLNAP40222 546 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 GPS2Q13227 327 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 NBPF14Q5TI25 921 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 NBPF15Q8N660 670 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MED15Q96RN5 788 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 C4AP0C0L4 1744 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 C4BP0C0L5 1744 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CUTAO60888 179 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF18P17022 549 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 XAGE2Q96GT9 111 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM66O15016 1216 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CHMP4BP1P59074 171 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MCM6Q14566 821 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 APPBP2Q92624 585 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SLIT3O75094 1523 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MYO1BO43795 1136 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 POSTNQ15063 836 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 APOA5Q6Q788 366 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 RAI14Q9P0K7 980 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.72□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 MEGF6O75095 1541 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 B4E1Z4 1266 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 AK7Q96M32 723 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 PNKPQ96T60 521 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 INCENPQ9NQS7 918 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 VPS18Q9P253 973 aa11.71□□□□□ -0.53
VWA3B-217ENST00000489630 RGPD5Q99666 1765 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC151A5D8V7 595 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 CYP27B1O15528 508 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 TEX33O43247 280 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 TRDNQ13061 729 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM29Q14134 588 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 MAP2K7O14733 419 aa11.7□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 CDKL5O76039 1030 aa11.7□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 CIAO1O76071 339 aa11.7□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 APPP05067 770 aa11.7□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC175P0C221 793 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms