RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 INHBEP58166 350 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPATCH3Q96I76 525 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GOLIM4O00461 696 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AAMPQ13685 434 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CERS3Q8IU89 383 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AK9Q5TCS8 1911 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP5JP18859 108 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPP4CP60510 307 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OTUD5Q96G74 571 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ALDH1A1P00352 501 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERO1BQ86YB8 467 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PAG1Q9NWQ8 432 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 INPP5BP32019 993 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GJA5P36382 358 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GTF2A2P52657 109 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OTOFQ9HC10 1997 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IFNL1Q8IU54 200 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HAUS7Q99871 368 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PICK1Q9NRD5 415 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TBC1D8O95759 1140 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDE6AP16499 860 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USP5P45974 858 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPATQ06203 517 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPIL2Q13356 520 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FLT1P17948 1338 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SNAPC2Q13487 334 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCL15Q16663 113 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DOCK2Q92608 1830 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TBC1D12O60347 775 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CETPP11597 493 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GCC1Q96CN9 775 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IRF6O14896 467 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HLA-DOAP06340 250 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAP3K10Q02779 954 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERC2O15083 957 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IFFO2Q5TF58 517 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM196BA6NMK8 535 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PALD1Q9ULE6 856 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms