RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	ERO1B	Q86YB8	467 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	LDHC	P07864	332 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	CCL15	Q16663	113 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	AACS	Q86V21	672 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	GTF2A2	P52657	109 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	CRHR2	Q13324	411 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	IRF6	O14896	467 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	FKTN	O75072	461 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	APBB1	O00213	710 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	PPIL2	Q13356	520 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	HMMR	O75330	724 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	MAP3K10	Q02779	954 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	PPAT	Q06203	517 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	CETP	P11597	493 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	SNAPC2	Q13487	334 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	TEX11	Q8IYF3	940 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PSME4-208	ENST00000481518	FAM196B	A6NMK8	535 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	BTBD19	C9JJ37	291 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	PPP4C	P60510	307 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	DOCK1	Q14185	1865 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	RAB11FIP3	O75154	756 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	BAG3	O95817	575 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	BCL11A	Q9H165	835 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	SIPA1L1	O43166	1804 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	IGSF3	O75054	1194 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	CYP7A1	P22680	504 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	CAP1	Q01518	475 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	MOGS	Q13724	837 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	TBC1D12	O60347	775 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	PLCG2	P16885	1265 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PSME4-208	ENST00000481518	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	PTPRA	P18433	802 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	PICK1	Q9NRD5	415 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	FLT1	P17948	1338 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	SP3	Q02447	781 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	TRIM17	Q9Y577	477 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	ERO1A	Q96HE7	468 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	MAP3K12	Q12852	859 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	CXCL11	O14625	94 aa		28.03	■■■□□ 2.08

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