RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 KIF22Q14807 665 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FAM196BA6NMK8 535 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ATP8B2P98198 1209 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PPIL2Q13356 520 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 CPA4Q9UI42 421 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 BTBD19C9JJ37 291 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MCAMP43121 646 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PPATQ06203 517 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF6Q15052 776 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TNNI3KQ59H18 835 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TEX11Q8IYF3 940 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 LAMB1P07942 1786 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 GAKO14976 1311 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM75PA6NK02 468 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PDHXO00330 501 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ENTPD3O75355 529 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 AACSQ86V21 672 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SSH3Q8TE77 659 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 DOCK1Q14185 1865 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 BAG3O95817 575 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ZAP70P43403 619 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 POLA2Q14181 598 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.88□□□□□ -0.83
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CTPS1-209ENST00000480420 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 IDI2Q9BXS1 227 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 COG6Q9Y2V7 657 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TLR2O60603 784 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2C8P10632 490 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A1P11836 297 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CYP7A1P22680 504 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF384Q8TF68 577 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 HTTP42858 3142 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 BRCA2P51587 3418 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 POTEFA5A3E0 1075 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRAP18433 802 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 PSMC4P43686 418 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 RHBDL3P58872 404 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CAP1Q01518 475 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 CEP85Q6P2H3 762 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 NBPF11Q86T75 865 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-209ENST00000480420 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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