RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480155.1

SHOC2-204, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-204	ENST00000480155	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	GRIK1	P39086	918 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	CDK8	P49336	464 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	SEPT6	Q14141	434 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	CSAD	Q9Y600	493 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	PRR19	A6NJB7	356 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM37	O94972	964 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	ASPA	P45381	313 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	ID3	Q02535	119 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRC14	Q15048	493 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	PAOX	Q6QHF9	649 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	PHC3	Q8NDX5	983 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	BACH2	Q9BYV9	841 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	LGR6	Q9HBX8	967 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SHOC2-204	ENST00000480155	RECK	O95980	971 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	SLFN14	P0C7P3	912 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	INPP5A	Q14642	412 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	DISC1	Q9NRI5	854 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ATG3	Q9NT62	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	NEFM	P07197	916 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	NFIC	P08651	508 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	TTLL4	Q14679	1199 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PPM1J	Q5JR12	505 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	SHISA5	Q8N114	240 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	F13B	P05160	661 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	LMNB1	P20700	586 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ITGAE	P38570	1179 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	BCL11A	Q9H165	835 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PF4	P02776	101 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	NTF4	P34130	210 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ADM	P35318	185 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ISL2	Q96A47	359 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	RHOV	Q96L33	236 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PIM2	Q9P1W9	311 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	GGT7	Q9UJ14	662 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ADAMTS4	O75173	837 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	SPINK2	P20155	84 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	ERVK-24	P63145	666 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	FANCC	Q00597	558 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SHOC2-204	ENST00000480155	DTX1	Q86Y01	620 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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