RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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SH3BP1-207ENST00000471650 SALL3Q9BXA9 1300 aa13.11□□□□□ -0.31
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SH3BP1-207ENST00000471650 USP17L4A6NCW7 530 aa13.1□□□□□ -0.31
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SH3BP1-207ENST00000471650 SEMA3EO15041 775 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP5JP18859 108 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-207ENST00000471650 MX1P20591 662 aa13.09□□□□□ -0.31
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SH3BP1-207ENST00000471650 FAM161BQ96MY7 647 aa13.09□□□□□ -0.31
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SH3BP1-207ENST00000471650 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-207ENST00000471650 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.09□□□□□ -0.31
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SH3BP1-207ENST00000471650 RASGRF1Q13972 1273 aa13.08□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.08□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 MCAMP43121 646 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 GTF2IP78347 998 aa13.07□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 SPATA5Q8NB90 893 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.07□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 HMG20BQ9P0W2 317 aa13.07□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.05□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 CCL15Q16663 113 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 PI16Q6UXB8 463 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 WDR66Q8TBY9 1149 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 HAUS7Q99871 368 aa13.05□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 JAG2Q9Y219 1238 aa13.05□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 CERS5Q8N5B7 392 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP1-207ENST00000471650 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP1-207ENST00000471650 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP1-207ENST00000471650 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.02□□□□□ -0.33
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SH3BP1-207ENST00000471650 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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