RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468220.1

CLDN16-203, Transcript of claudin 16, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN16, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-203ENST00000468220 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 USP40Q9NVE5 1235 aa8.39□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.39□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.39□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.38□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 TRIM75PA6NK02 468 aa8.38□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.38□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.38□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.38□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.38□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 CYP2B6P20813 491 aa8.37□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.37□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.37□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 SPEF2Q9C093 1822 aa8.37□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 PFASO15067 1338 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 F6X3S4 739 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 TNFRSF10AO00220 468 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 PDE8BO95263 885 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 NFIAQ12857 509 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 PDE3AQ14432 1141 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 BEND3Q5T5X7 828 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.36□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 GJD2Q9UKL4 321 aa8.36□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 COL6A1P12109 1028 aa8.35□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.34□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 HTTP42858 3142 aa8.34□□□□□ -1.07
CLDN16-203ENST00000468220 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.34□□□□□ -1.07
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CLDN16-203ENST00000468220 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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CLDN16-203ENST00000468220 SLF2Q8IX21 1173 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLDN16-203ENST00000468220 IDI2Q9BXS1 227 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 MYH3P11055 1940 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 CEP290O15078 2479 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 KIF16BQ96L93 1317 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 CNGA1P29973 690 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN16-203ENST00000468220 PRDX5P30044 214 aa8.32□□□□□ -1.08
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