RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXL18Q96ME1 805 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 CEP44Q9C0F1 390 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 SPG7Q9UQ90 795 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ENC1O14682 589 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO24O75426 580 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ABI1Q8IZP0 508 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 NEFMP07197 916 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM87AP0C7U9 286 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 C12orf49Q9H741 205 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 SAMM50Q9Y512 469 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 PAGE1O75459 146 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 BMP6P22004 513 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 TXKP42681 527 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ERVK-24P63145 666 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-204ENST00000461653 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 FLCNQ8NFG4 579 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 ISL2Q96A47 359 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L7P0C7H9 530 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF214Q8ND24 703 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM37O94972 964 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 CELA3AP09093 270 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.171e-33■□□□□ 9.2
RABGGTB-204ENST00000461653 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 CSADQ9Y600 493 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 LEFTY1O75610 366 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC14Q15048 493 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PPM1JQ5JR12 505 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 RASIP1Q5U651 963 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 FRMD6Q96NE9 622 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PICK1Q9NRD5 415 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 NETO1Q8TDF5 533 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 MISP3Q96FF7 219 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 GNA15P30679 374 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 NTF4P34130 210 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 CBLL1Q75N03 491 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 C12orf40Q86WS4 652 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 U3KQE9 123 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 COL19A1Q14993 1142 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SV2BQ7L1I2 683 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 FGD1P98174 961 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 RING1Q06587 406 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF114Q9Y508 228 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 FANCGO15287 622 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 BNIP3Q12983 259 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRED2Q7Z698 418 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 CEACAM5P06731 702 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 OXCT1P55809 520 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PLCL1Q15111 1095 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms