RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATAD5Q96QE3 1844 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OSBPP22059 807 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRK4P32298 578 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGS3P49796 1198 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MTX1Q13505 466 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCYL3Q8IZE3 742 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYPNQ86TC9 1320 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GJB1P08034 283 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAPN2P17655 700 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPRAP18433 802 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RASGRF1Q13972 1273 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAET1EQ8TD07 263 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PICK1Q9NRD5 415 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AKAP2Q9Y2D5 859 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBC1D12O60347 775 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADORA1P30542 326 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GJA8P48165 433 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FCGRTP55899 365 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TIMM10P62072 90 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MTFR1Q15390 333 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SHISA4Q96DD7 197 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MEIS3Q99687 375 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZHX2Q9Y6X8 837 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A1B0GUL7 405 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GNAI3P08754 354 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CYP2C8P10632 490 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBXN2AP68543 259 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 XAGE2Q96GT9 111 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABCF2Q9UG63 623 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FOCADQ5VW36 1801 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H0YGN5 161 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SRGAP3O43295 1099 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCL5P13501 91 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BTDP43251 543 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RHBDL3P58872 404 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRKCZQ05513 592 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MECOMQ03112 1051 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TFCP2Q12800 502 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IRF5Q13568 498 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF384Q8TF68 577 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LDHCP07864 332 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GSTO1P78417 241 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GADL1Q6ZQY3 521 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RNF208Q9H0X6 261 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HMG20BQ9P0W2 317 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GABRQQ9UN88 632 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SIPA1L1O43166 1804 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADCY3O60266 1144 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SGPL1O95470 568 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FLT3LGP49771 235 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PICALMQ13492 652 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA5Q8NB90 893 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PNMA3Q9UL41 463 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL6A3P12111 3177 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ALPK3Q96L96 1907 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM75PA6NK02 468 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms