RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.59□□□□□ -0.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.59□□□□□ -0.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOCADQ5VW36 1801 aa13.59□□□□□ -0.23
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLT1P17948 1338 aa13.59□□□□□ -0.23
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.58□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa13.58□□□□□ -0.24
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INPP5BP32019 993 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPATQ06203 517 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PICALMQ13492 652 aa13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WRNIP1Q96S55 665 aa13.57□□□□□ -0.24
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