RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449814.1

TNS1-211, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-211ENST00000449814 RAET1EQ8TD07 263 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 DEFB118Q96PH6 123 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 USP40Q9NVE5 1235 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS1-211ENST00000449814 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 UNCXA6NJT0 531 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TRIM75PA6NK02 468 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 DLL1O00548 723 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ALDH1L1O75891 902 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 INHAP05111 366 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PPATQ06203 517 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PICALMQ13492 652 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FAM83AQ86UY5 434 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 WDR63Q8IWG1 891 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FAM151AQ8WW52 585 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ADCY3O60266 1144 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 GJB1P08034 283 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PTPRAP18433 802 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TIMM10P62072 90 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 KIF22Q14807 665 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ZNF521Q96K83 1311 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 MUC3AQ02505 3323 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 EYA2O00167 538 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 SGPL1O95470 568 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 EVX2Q03828 476 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 RASGRF1Q13972 1273 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.3□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 RHBDL3P58872 404 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ATP2B3Q16720 1220 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 DCAF15Q66K64 600 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 MEIS3Q99687 375 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 REV3LO60673 3130 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PFASO15067 1338 aa8.29□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 EVI5O60447 810 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 SLC5A1P13866 664 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 BTDP43251 543 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 HMGCS2P54868 508 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FCGRTP55899 365 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 SPP2Q13103 211 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 CCL14Q16627 93 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 Q3C1V9 767 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 CCDC102BQ68D86 513 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 TRIB2Q92519 343 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 LPIN2Q92539 896 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 FAM161BQ96MY7 647 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 GDF15Q99988 308 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 DNAJC18Q9H819 358 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 ABCF2Q9UG63 623 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 GJD2Q9UKL4 321 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 GAKO14976 1311 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-211ENST00000449814 CYP2B6P20813 491 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-211ENST00000449814 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-211ENST00000449814 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-211ENST00000449814 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms