RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 AOC2O75106 756 aa20.42■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 NUCB1Q02818 461 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 WBP1LQ9NX94 342 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.41■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.4■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 DOCK2Q92608 1830 aa20.4■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D12O60347 775 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE1AP54750 535 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 SPRYD7Q5W111 196 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 ZIC5Q96T25 663 aa20.38■□□□□ 0.85
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RABGEF1-204ENST00000442563 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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RABGEF1-204ENST00000442563 CSADQ9Y600 493 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.37■□□□□ 0.85
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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RABGEF1-204ENST00000442563 USP5P45974 858 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 INHBEP58166 350 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 TICAM2Q86XR7 235 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 CA12O43570 354 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 TM4SF4P48230 202 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 AIDAQ96BJ3 306 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 ELP3Q9H9T3 547 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 INPP5BP32019 993 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 ERO1BQ86YB8 467 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 APPBP2Q92624 585 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 EVI5LQ96CN4 794 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 OPTNQ96CV9 577 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGEF1-204ENST00000442563 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 CHGBP05060 677 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 LCORLQ8N3X6 602 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 AK9Q5TCS8 1911 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD4O95243 580 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-DOAP06340 250 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 GJA5P36382 358 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 PPATQ06203 517 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 SREBF2Q12772 1141 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC6Q86TZ1 520 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 ARMT1Q9H993 441 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGEF1-204ENST00000442563 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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