RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PLD2O14939 933 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RASGRP1O95267 797 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 F11P03951 625 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ARNTP27540 789 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCY2FP51841 1108 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 VHLLQ6RSH7 139 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 UBR7Q8N806 425 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC3BQ9H195 1237 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.17□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 EFSO43281 561 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NRLP54845 237 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MCL1Q07820 350 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 LAMC2Q13753 1193 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PBX4Q9BYU1 374 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.16□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 SUSD5O60279 629 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GALT4O96024 378 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 BMP2P12643 396 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDH1Q08174 1060 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MLECQ14165 292 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP4X1Q8N118 509 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RIN3Q8TB24 985 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 STK35Q8TDR2 534 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 BSNDQ8WZ55 320 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.15□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.15□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SHTN1A0MZ66 631 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 AGRPO00253 132 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 RAPGEF3O95398 923 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SCGB1D2O95969 90 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MYL1P05976 194 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNFP41002 786 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SIK1P57059 783 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 RALBP1Q15311 655 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC41Q15345 812 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf46Q504U0 113 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.14□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 HTR3BO95264 441 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ARAFP10398 606 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ATF3P18847 181 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 L1CAMP32004 1257 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 NEK2P51955 445 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SPEM2Q0P670 501 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CHPFQ8IZ52 775 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 BHMTQ93088 406 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOC2Q96KP1 924 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC6Q99741 560 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 GMIPQ9P107 970 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.13□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL8A6PVC2 850 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 KATNA1O75449 491 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 EYA4O95677 639 aa6.12□□□□□ -1.43
CBX1P4-201ENST00000439415 ACRP10323 421 aa6.12□□□□□ -1.43
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