RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.28■□□□□ 0.2
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PTPRU-204ENST00000428026 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN26Q16670 478 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRU-204ENST00000428026 MTX1Q13505 466 aa16.22■□□□□ 0.19
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