RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.7■■□□□ 1.06
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC39A14Q15043 492 aa21.7■■□□□ 1.06
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.68■■□□□ 1.06
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDX5P30044 214 aa21.68■■□□□ 1.06
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GUCY1A2P33402 732 aa21.68■■□□□ 1.06
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTR9Q6PD62 1173 aa21.68■■□□□ 1.06
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FANCBQ8NB91 859 aa21.68■■□□□ 1.06
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB22O15209 634 aa21.67■■□□□ 1.06
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