RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADORA1P30542 326 aa16.37■□□□□ 0.21
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNAI3P08754 354 aa16.29■□□□□ 0.2
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLT3LGP49771 235 aa16.29■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTX1Q13505 466 aa16.29■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF384Q8TF68 577 aa16.29■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D12O60347 775 aa16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INHAP05111 366 aa16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.28■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.27■□□□□ 0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM196BA6NMK8 535 aa16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELNP15502 786 aa16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF5Q13568 498 aa16.27■□□□□ 0.19
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