RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416743.1

CGN-202, Transcript of cingulin, humanhuman

TSL 5

Gene CGN, Length 394 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGN-202ENST00000416743 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.59□□□□□ -0.07
CGN-202ENST00000416743 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CGN-202ENST00000416743 ADCY3O60266 1144 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 CIAO1O76071 339 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 FLT3LGP49771 235 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 LAMA3Q16787 3333 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.58□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 DOCK2Q92608 1830 aa14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 GAKO14976 1311 aa14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 CEP290O15078 2479 aa14.57□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PTPRFP10586 1907 aa14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ANP32CO43423 234 aa14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PICK1Q9NRD5 415 aa14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.56□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 EVI5O60447 810 aa14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 INHAP05111 366 aa14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 RGS3P49796 1198 aa14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ATP2B3Q16720 1220 aa14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 DOCK1Q14185 1865 aa14.55□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 TBC1D12O60347 775 aa14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PHKA1P46020 1223 aa14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 SLF2Q8IX21 1173 aa14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ELNP15502 786 aa14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 CCDC102BQ68D86 513 aa14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 DEFB118Q96PH6 123 aa14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CGN-202ENST00000416743 BMP8BP34820 402 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 GPR153Q6NV75 609 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 COA7Q96BR5 231 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 PNMA3Q9UL41 463 aa14.52□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 TRIM75PA6NK02 468 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 E9PSI1 815 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 GDF15Q99988 308 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 SIL1Q9H173 461 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 COPRSQ9NQ92 184 aa14.51□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 RHBDL3P58872 404 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 RASGRF1Q13972 1273 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 STAP2Q9UGK3 403 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 ALPK3Q96L96 1907 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 A0A0C4DFX4 3053 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.5□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 SLURP2P0DP57 97 aa14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 BTDP43251 543 aa14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 TREML2Q5T2D2 321 aa14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 ABCF2Q9UG63 623 aa14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 GJD2Q9UKL4 321 aa14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.49□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 RPTORQ8N122 1335 aa14.48□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 DLL1O00548 723 aa14.48□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 HMGCRP04035 888 aa14.48□□□□□ -0.09
CGN-202ENST00000416743 ADORA1P30542 326 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms