RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 TEX11Q8IYF3 940 aa21.85■■□□□ 1.09
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SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.76■■□□□ 1.07
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SEMA3B-201ENST00000416295 ELP3Q9H9T3 547 aa21.75■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D12O60347 775 aa21.74■■□□□ 1.07
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SEMA3B-201ENST00000416295 AK9Q5TCS8 1911 aa21.74■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.73■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.73■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.72■■□□□ 1.07
SEMA3B-201ENST00000416295 INPP5BP32019 993 aa21.72■■□□□ 1.07
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SEMA3B-201ENST00000416295 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
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SEMA3B-201ENST00000416295 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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SEMA3B-201ENST00000416295 TM4SF4P48230 202 aa21.7■■□□□ 1.06
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