RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 ERICH2A1L162 156 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CCDC69A6NI79 296 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 MRE11P49959 708 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ZBTB43O43298 467 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 MSL1Q68DK7 614 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CTR9Q6PD62 1173 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ESR2Q92731 530 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SENP2Q9HC62 589 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 LTBP1Q14766 1721 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CDKL5O76039 1030 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 LDHCP07864 332 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 FOSBP53539 338 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 TMTC2Q8N394 836 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 PPFIA3O75145 1194 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 WTAPQ15007 396 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 USP17L12C9JPN9 530 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 USP17L21D6R901 530 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 MICU3Q86XE3 530 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 MASTLQ96GX5 879 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 BAG3O95817 575 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ELP1O95163 1332 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SLC15A2Q16348 729 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.16■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 FGRP09769 529 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 RXRAP19793 462 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SBK1Q52WX2 424 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 MPNDQ8N594 471 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 C8orf76Q96K31 380 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 STK32BQ9NY57 414 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 LAMB1P07942 1786 aa22.15■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 GRIK5Q16478 980 aa22.14■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 TTC6Q86TZ1 520 aa22.14■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 SPATA32Q96LK8 384 aa22.14■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
USP39-202ENST00000409025 CDC27P30260 824 aa22.14■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 PPP4CP60510 307 aa22.14■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.14■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 CERS3Q8IU89 383 aa22.14■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 RGS22Q8NE09 1264 aa22.14■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 CFAP45Q9UL16 551 aa22.14■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.14■■□□□ 1.13
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USP39-202ENST00000409025 USP5P45974 858 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 GUCY1B3Q02153 619 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 MYL10Q9BUA6 226 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 COA1Q9GZY4 146 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 NID2Q14112 1375 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 RCAN1P53805 252 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 TNKSO95271 1327 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 SYCE3A1L190 88 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 RIMBP2O15034 1052 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ORC4O43929 436 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 SLF2Q8IX21 1173 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 SEC23AQ15436 765 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 ATL3Q6DD88 541 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-202ENST00000409025 IQCA1Q86XH1 822 aa22.11■■□□□ 1.13
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