RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 OTUD5Q96G74 571 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D8O95759 1140 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 INPP5BP32019 993 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP7A1P22680 504 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRN2-204ENST00000404321 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 IFFO2Q5TF58 517 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 OTOFQ9HC10 1997 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 GOLIM4O00461 696 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 BAG3O95817 575 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 DCTPP1Q9H773 170 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 CAPN15O75808 1086 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K12Q12852 859 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 IFNL1Q8IU54 200 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM196BA6NMK8 535 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 ERO1BQ86YB8 467 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPN18Q99952 460 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 PLCG2P16885 1265 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 INHBEP58166 350 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP4CP60510 307 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2-204ENST00000404321 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 IRF6O14896 467 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP5JP18859 108 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 CCL15Q16663 113 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 GTF2A2P52657 109 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 FLT1P17948 1338 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 IGSF3O75054 1194 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 ALDH1A1P00352 501 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PDE6AP16499 860 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PPIL2Q13356 520 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 HAUS7Q99871 368 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 AK9Q5TCS8 1911 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 GPR25O00155 361 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K10Q02779 954 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PPATQ06203 517 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SNAPC2Q13487 334 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 DGKZQ13574 1117 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PICK1Q9NRD5 415 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PALD1Q9ULE6 856 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 CETPP11597 493 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 USP5P45974 858 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 CRHR2Q13324 411 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 CHGBP05060 677 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 DOCK2Q92608 1830 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D12O60347 775 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2-204ENST00000404321 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPRAP18433 802 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2-204ENST00000404321 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2-204ENST00000404321 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2-204ENST00000404321 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.01■■□□□ 1.11
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