RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.28■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 NF2P35240 595 aa36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 HTRA3P83110 453 aa36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 TICAM2Q86XR7 235 aa36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 FLT1P17948 1338 aa36.26■■■■□ 3.4
PKDCC-202ENST00000401498 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa36.26■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 AIDAQ96BJ3 306 aa36.26■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 FZD1Q9UP38 647 aa36.25■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 SDSP20132 328 aa36.24■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 MOB2Q70IA6 237 aa36.24■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 C2orf69Q8N8R5 385 aa36.24■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 M0R2C6 588 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 PRKG1Q13976 671 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 ATRNL1Q5VV63 1379 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 USP5P45974 858 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 MYH1P12882 1939 aa36.22■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 SAPCD2Q86UD0 394 aa36.22■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 SDR42E1Q8WUS8 393 aa36.22■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 TLL2Q9Y6L7 1015 aa36.22■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 PRKAB2O43741 272 aa36.21■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 FKBP1BP68106 108 aa36.21■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 CSRNP1Q96S65 589 aa36.21■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
PKDCC-202ENST00000401498 GPAA1O43292 621 aa36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 FAM227BQ96M60 508 aa36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 USP2O75604 605 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0D9SFI3 127 aa36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 MIGA2Q7L4E1 593 aa36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 HOOK2Q96ED9 719 aa36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 PALD1Q9ULE6 856 aa36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 NAV1Q8NEY1 1877 aa36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2Q2LH0YL09 131 aa36.17■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 HELLSQ9NRZ9 838 aa36.17■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 CEP350Q5VT06 3117 aa36.17■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 HUNKP57058 714 aa36.16■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K11Q16584 847 aa36.16■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 ARMC9Q7Z3E5 817 aa36.16■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 SIPA1L1O43166 1804 aa36.16■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 SLURP2P0DP57 97 aa36.15■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa36.15■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa36.15■■■■□ 3.38
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K10Q02779 954 aa36.13■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa36.13■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 LDLRAD1Q5T700 205 aa36.13■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF15Q66K64 600 aa36.13■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa36.13■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 RASSF10A6NK89 507 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 GSG1L2A8MUP6 293 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 HIP1O00291 1037 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 BMP2KLQ5H9B9 411 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 KLRG1Q96E93 195 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 MCM9Q9NXL9 1143 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 PI4KBQ9UBF8 816 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 OTOFQ9HC10 1997 aa36.12■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 GNAT2P19087 354 aa36.11■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 IREB2P48200 963 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.1■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 HHIPL1Q96JK4 782 aa36.1■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF341Q9BYN7 854 aa36.1■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.373e-8■■■□□ 14.8
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D12O60347 775 aa36.09■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 FAM196BA6NMK8 535 aa36.08■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 PLCD1P51178 756 aa36.08■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DOAP06340 250 aa36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 CHMLP26374 656 aa36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 TTC6Q86TZ1 520 aa36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF112Q9UJU3 913 aa36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-202ENST00000401498 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 EVX2Q03828 476 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 RGMBQ6NW40 437 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 GIMAP6Q6P9H5 292 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
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