RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLRG1Q96E93 195 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATRNL1Q5VV63 1379 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PICALMQ13492 652 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGMBQ6NW40 437 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APPBP2Q92624 585 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC102AQ96A19 550 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSRNP1Q96S65 589 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FSD1Q9BTV5 496 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLT1P17948 1338 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP5P45974 858 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K10Q02779 954 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AIDAQ96BJ3 306 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPNS2Q96L46 248 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D12O60347 775 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE4AP27815 886 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBD4O95243 580 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VEGFBP49765 207 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOGQ13253 232 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKG1Q13976 671 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MOB2Q70IA6 237 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JMYQ8N9B5 988 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PI4KBQ9UBF8 816 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.41■□□□□ 0.54
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DOAP06340 250 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC10A3P09131 477 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNAT2P19087 354 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP2K2P36507 400 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K9P80192 1104 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCORLQ8N3X6 602 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSADQ9Y600 493 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC6Q86TZ1 520 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSBP2Q969R2 916 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WRNIP1Q96S55 665 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARMT1Q9H993 441 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.39■□□□□ 0.53
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIP1O00291 1037 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC22Q5TAA0 569 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EHD4Q9H223 541 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHGBP05060 677 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RILPL2Q969X0 211 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FZD1Q9UP38 647 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPAA1O43292 621 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VGLL4Q14135 290 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.36■□□□□ 0.53
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