RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SALL1Q9NSC2 1324 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PTPDC1A2A3K4 754 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ATP2B4P23634 1241 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MRE11P49959 708 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CHST3Q7LGC8 479 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 WDR66Q8TBY9 1149 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NBPF3Q9H094 633 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 IRS2Q9Y4H2 1338 aa13.07□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CDKL5O76039 1030 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ANTXR2P58335 489 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 DDR1Q08345 913 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 RGS22Q8NE09 1264 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 BRIP1Q9BX63 1249 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 LTBP1Q14766 1721 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CPLX1O14810 134 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 JAK2O60674 1132 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 KLRK1P26718 216 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF445P59923 1031 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 UBE2HP62256 183 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 USP48Q86UV5 1035 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CERS3Q8IU89 383 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GPT2Q8TD30 523 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GGA1Q9UJY5 639 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CNPY2Q9Y2B0 182 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NEDD4P46934 1319 aa13.05□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ERICH2A1L162 156 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 B4E1Z4 1266 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 FIBPO43427 364 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 LIFRP42702 1097 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NT5C2P49902 561 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GSTO1P78417 241 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MECOMQ03112 1051 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PPARAQ07869 468 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF827Q17R98 1081 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ELP1O95163 1332 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PRKAB2O43741 272 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 UFL1O94874 794 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ADGRA1Q86SQ6 560 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TMTC2Q8N394 836 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 DDX11Q96FC9 970 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 DLEC1Q9Y238 1755 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC69A6NI79 296 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 KDM4AO75164 1064 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CTDNEP1O95476 244 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 LDHBP07195 334 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PDE6BP35913 854 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 RCAN1P53805 252 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GPSM2P81274 684 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ATL3Q6DD88 541 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ESR2Q92731 530 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms