RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369125.6

HACE1-202, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HACE1, Length 3,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-202ENST00000369125 TMEM51Q9NW97 253 aa21.53■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.53■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 FAM89AQ96GI7 184 aa21.53■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 TBC1D8O95759 1140 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 ATG3Q9NT62 314 aa21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HACE1-202ENST00000369125 ST5P78524 1137 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 PRR29P0C7W0 189 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MAP3K9P80192 1104 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GRIN1Q05586 938 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 METTL24Q5JXM2 366 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 TC2NQ8N9U0 490 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 DHX58Q96C10 678 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MCAMP43121 646 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 POSTNQ15063 836 aa21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 STX10O60499 249 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 BTBD18B2RXH4 712 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MTF1Q14872 753 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.5■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SMARCE1Q969G3 411 aa21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GYS2P54840 703 aa21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MYO1BO43795 1136 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 TOMM22Q9NS69 142 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 ADD2P35612 726 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.48■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GOLGA1Q92805 767 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 NTRK3Q16288 839 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 RAI14Q9P0K7 980 aa21.47■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GUCY1A2P33402 732 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 SYNE4Q8N205 404 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 KIFC2Q96AC6 838 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 LY9Q9HBG7 655 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 DACH1Q9UI36 760 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 ATP8B1O43520 1251 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HACE1-202ENST00000369125 GPS2Q13227 327 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 MLKLQ8NB16 471 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 AIDAQ96BJ3 306 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 TMEM87BQ96K49 555 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 RABGGTAQ92696 567 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 SPEF2Q9C093 1822 aa21.45■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 KIF1AQ12756 1690 aa21.44■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 CCDC175P0C221 793 aa21.44■■□□□ 1.02
HACE1-202ENST00000369125 STX17P56962 302 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms