RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 PPIP5K2O43314 1243 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TXKP42681 527 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ERBB4Q15303 1308 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ATP2A1O14983 1001 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TFAP4Q01664 338 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 PSMD1Q99460 953 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 USP44Q9H0E7 712 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 NOD1Q9Y239 953 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ABCA8O94911 1581 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 GJC1P36383 396 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 GTF2IP78347 998 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 BIRC3Q13489 604 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 GPR162Q16538 588 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 NSMFQ6X4W1 530 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 PDE4DQ08499 809 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CHMP2AO43633 222 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CTSWP56202 376 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CBX1P83916 185 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CTAGE9A4FU28 777 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 H7C1D1 291 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 KCNQ3O43525 872 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TAF12Q16514 161 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CNGA4Q8IV77 575 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC169A6NNP5 214 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ZBED4O75132 1171 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 HSF2BPO75031 334 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TTC38Q5R3I4 469 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 TEKT1Q969V4 418 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 IFT74Q96LB3 600 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 PRKG1Q13976 671 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 INSRP06213 1382 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 SSH3Q8TE77 659 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 MYL10Q9BUA6 226 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 USP17L12C9JPN9 530 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 USP17L21D6R901 530 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 CETN3O15182 167 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 ADCY7P51828 1080 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 TNFAIP1Q13829 316 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 GINS2Q9Y248 185 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1W2PRG0 241 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 WDR44Q5JSH3 913 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 USP40Q9NVE5 1235 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 CFBP00751 764 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 CUTAO60888 179 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 SIK1P57059 783 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 KRT40Q6A162 431 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 PHKBQ93100 1093 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF548-202ENST00000366197 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms