RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMPD1P23109 780 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CKAP2LQ8IYA6 745 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC9Q92623 222 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA32Q96LK8 384 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKAG3Q9UGI9 489 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM177BA6PVY3 158 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM37O94972 964 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCRP11274 1271 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 GIPRP48546 466 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIP4K2BP78356 416 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP3B2Q13367 1082 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC14Q15048 493 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPM1JQ5JR12 505 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARMC5Q96C12 935 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM11Q96F44 468 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CORO1BQ9BR76 489 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR18Q9BV38 432 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNTG2Q9NY99 539 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHL3Q9UH77 587 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNRF3Q9ULT6 936 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBX22Q9Y458 520 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAMM50Q9Y512 469 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 GFRA2O00451 464 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 HTR3BO95264 441 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLURP2P0DP57 97 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 DGKGP49619 791 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB33AQ14088 237 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASA3Q14644 834 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP2R5EQ16537 467 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 OVOS1Q6IE37 1185 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM55Q9BYV6 548 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 RRAGCQ9HB90 399 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM86C1Q9NVL1 165 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHB10Q9UN67 800 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAM23O75077 832 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 AOC2O75106 756 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACRP10323 421 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRD2P14416 443 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRK4P32298 578 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL4DP49703 201 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF165P49910 485 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCEAL1Q15170 157 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SHISA2Q6UWI4 295 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ILDR2Q71H61 639 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SVOPQ8N4V2 548 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELMO3Q96BJ8 720 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBRSQ9HAH7 460 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTR10Q9NZ32 417 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIF3AQ9Y2N7 669 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ROBO2Q9HCK4 1378 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CADPSQ9ULU8 1353 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PQH9 124 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMPRSS2O15393 492 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALX3O95076 343 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 GJB6O95452 261 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP11A1P05108 521 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEFMP07197 916 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLCG1P19174 1290 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 NTF4P34130 210 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD68P34810 354 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKG7Q16617 165 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDR2Q16832 855 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARSHQ5FYA8 562 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAPPC3LQ5T215 181 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms